MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp9

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015911	ATT	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015911	ATA	2	6	19	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015911	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015911	AAT	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015911	TAAAA	2	10	92	101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015911	CAAC	2	8	167	174	50 %	0 %	0 %	50 %	343127106
7	NC_015911	TAG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127106
8	NC_015911	ATAA	2	8	244	251	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
9	NC_015911	AC	3	6	266	271	50 %	0 %	0 %	50 %	343127106
10	NC_015911	A	7	7	272	278	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
11	NC_015911	T	7	7	288	294	0 %	100 %	0 %	0 %	343127106
12	NC_015911	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
13	NC_015911	A	6	6	470	475	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
14	NC_015911	AATA	2	8	478	485	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
15	NC_015911	A	8	8	494	501	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
16	NC_015911	ATA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
17	NC_015911	ATA	3	9	596	604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
18	NC_015911	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
19	NC_015911	GAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127106
20	NC_015911	A	7	7	614	620	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
21	NC_015911	ATA	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
22	NC_015911	TTAGAT	2	12	703	714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	343127106
23	NC_015911	AAATT	2	10	764	773	60 %	40 %	0 %	0 %	343127106
24	NC_015911	A	6	6	777	782	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
25	NC_015911	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
26	NC_015911	AAAAG	2	10	813	822	80 %	0 %	20 %	0 %	343127106
27	NC_015911	A	7	7	869	875	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
28	NC_015911	A	7	7	910	916	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
29	NC_015911	TAT	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
30	NC_015911	A	7	7	1017	1023	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
31	NC_015911	AAC	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127106
32	NC_015911	A	7	7	1089	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
33	NC_015911	AAAT	2	8	1097	1104	75 %	25 %	0 %	0 %	343127106
34	NC_015911	TAT	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
35	NC_015911	A	6	6	1129	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
36	NC_015911	ATT	2	6	1184	1189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
37	NC_015911	ATT	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
38	NC_015911	A	6	6	1217	1222	100 %	0 %	0 %	0 %	343127106
39	NC_015911	TAGA	2	8	1244	1251	50 %	25 %	25 %	0 %	343127106
40	NC_015911	TA	3	6	1257	1262	50 %	50 %	0 %	0 %	343127106
41	NC_015911	A	7	7	1306	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
42	NC_015911	A	6	6	1326	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
43	NC_015911	A	7	7	1341	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
44	NC_015911	ATA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
45	NC_015911	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127107
46	NC_015911	AGT	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127107
47	NC_015911	A	8	8	1420	1427	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
48	NC_015911	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	343127107
49	NC_015911	A	8	8	1498	1505	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
50	NC_015911	T	6	6	1526	1531	0 %	100 %	0 %	0 %	343127107
51	NC_015911	A	6	6	1551	1556	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
52	NC_015911	A	6	6	1588	1593	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
53	NC_015911	T	6	6	1649	1654	0 %	100 %	0 %	0 %	343127107
54	NC_015911	TAA	2	6	1679	1684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
55	NC_015911	A	7	7	1683	1689	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
56	NC_015911	AGAT	2	8	1694	1701	50 %	25 %	25 %	0 %	343127107
57	NC_015911	TAA	2	6	1710	1715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
58	NC_015911	TTG	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127107
59	NC_015911	A	6	6	1771	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
60	NC_015911	ATT	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127107
61	NC_015911	A	6	6	1812	1817	100 %	0 %	0 %	0 %	343127107
62	NC_015911	ATA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
63	NC_015911	GTG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127108
64	NC_015911	ATT	2	6	1889	1894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
65	NC_015911	CTA	3	9	1942	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
66	NC_015911	TAA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
67	NC_015911	A	7	7	1962	1968	100 %	0 %	0 %	0 %	343127108
68	NC_015911	GAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127108
69	NC_015911	TA	4	8	2003	2010	50 %	50 %	0 %	0 %	343127108
70	NC_015911	ATT	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
71	NC_015911	TAA	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
72	NC_015911	ATC	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
73	NC_015911	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
74	NC_015911	ATTAT	2	10	2176	2185	40 %	60 %	0 %	0 %	343127108
75	NC_015911	TTA	2	6	2233	2238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
76	NC_015911	CAG	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127108
77	NC_015911	ACT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
78	NC_015911	T	6	6	2304	2309	0 %	100 %	0 %	0 %	343127108
79	NC_015911	ATAA	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	343127108
80	NC_015911	CAA	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127108
81	NC_015911	A	8	8	2361	2368	100 %	0 %	0 %	0 %	343127108
82	NC_015911	A	8	8	2401	2408	100 %	0 %	0 %	0 %	343127108
83	NC_015911	TAT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
84	NC_015911	AGA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127108
85	NC_015911	ATG	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127108
86	NC_015911	TAGA	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	343127108
87	NC_015911	TA	3	6	2493	2498	50 %	50 %	0 %	0 %	343127108
88	NC_015911	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
89	NC_015911	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015911	AAT	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
91	NC_015911	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
92	NC_015911	A	6	6	2681	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	343127109
93	NC_015911	ATA	2	6	2695	2700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
94	NC_015911	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
95	NC_015911	ACA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127109
96	NC_015911	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
97	NC_015911	GAG	2	6	2937	2942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127109
98	NC_015911	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127109
99	NC_015911	A	6	6	3012	3017	100 %	0 %	0 %	0 %	343127109
100	NC_015911	A	8	8	3084	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	343127109
101	NC_015911	GAA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
102	NC_015911	CTT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127109
103	NC_015911	A	6	6	3150	3155	100 %	0 %	0 %	0 %	343127109
104	NC_015911	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
105	NC_015911	AAT	2	6	3204	3209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015911	TAA	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015911	TAAAC	2	10	3319	3328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015911	AAT	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015911	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015911	TAC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015911	ATC	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015911	T	7	7	3439	3445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015911	T	6	6	3452	3457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015911	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015911	TATT	2	8	3497	3504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015911	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	343127110
117	NC_015911	T	6	6	3576	3581	0 %	100 %	0 %	0 %	343127110
118	NC_015911	TAG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127110
119	NC_015911	A	6	6	3696	3701	100 %	0 %	0 %	0 %	343127110
120	NC_015911	TGT	2	6	3768	3773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127110
121	NC_015911	TTG	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127110
122	NC_015911	GAAAAT	2	12	4000	4011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	343127110
123	NC_015911	AACAAA	2	12	4052	4063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	343127110
124	NC_015911	TAT	2	6	4105	4110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127110
125	NC_015911	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	343127110
126	NC_015911	GAA	3	9	4165	4173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127110
127	NC_015911	A	7	7	4172	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	343127110
128	NC_015911	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127110
129	NC_015911	TGA	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127110
130	NC_015911	ATA	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127110
131	NC_015911	ACG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127110
132	NC_015911	A	7	7	4404	4410	100 %	0 %	0 %	0 %	343127110
133	NC_015911	TA	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	343127110
134	NC_015911	ATA	2	6	4443	4448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127110
135	NC_015911	ATT	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015911	TA	3	6	4519	4524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015911	CTAT	2	8	4528	4535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015911	ATT	2	6	4556	4561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015911	TCTT	2	8	4645	4652	0 %	75 %	0 %	25 %	343127111
140	NC_015911	AAT	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127111
141	NC_015911	AAAC	2	8	4805	4812	75 %	0 %	0 %	25 %	343127111
142	NC_015911	ATTT	2	8	4820	4827	25 %	75 %	0 %	0 %	343127111
143	NC_015911	T	6	6	4825	4830	0 %	100 %	0 %	0 %	343127111
144	NC_015911	AC	3	6	4865	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	343127111
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146	NC_015911	TTAA	2	8	4984	4991	50 %	50 %	0 %	0 %	343127111
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149	NC_015911	A	9	9	5088	5096	100 %	0 %	0 %	0 %	343127111
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152	NC_015911	TAA	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015911	TA	3	6	5883	5888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_015911	TAA	2	6	6388	6393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015911	TAA	2	6	9599	9604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127117
282	NC_015911	AT	3	6	9646	9651	50 %	50 %	0 %	0 %	343127117
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285	NC_015911	GTTT	2	8	9773	9780	0 %	75 %	25 %	0 %	343127117
286	NC_015911	T	6	6	9872	9877	0 %	100 %	0 %	0 %	343127117
287	NC_015911	ATC	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
288	NC_015911	TTG	2	6	9936	9941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127117
289	NC_015911	ATT	2	6	9969	9974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
290	NC_015911	T	6	6	9973	9978	0 %	100 %	0 %	0 %	343127117
291	NC_015911	AATA	2	8	10011	10018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015911	A	6	6	10031	10036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015911	T	7	7	10039	10045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015911	T	6	6	10051	10056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015911	A	6	6	10059	10064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015911	TTAG	2	8	10100	10107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015911	AT	3	6	10151	10156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015911	TAAAAT	2	12	10196	10207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.